Das Problem habe ich auch. Zwar scheint das bei mir nicht mit der Anzahl der offenen Fenster zu tun zu haben, aber im Prinzip entspricht deine Beschreibung genau meinen Erlebnissen - dazu hatte ich hier schon einmal eine Anmerkung verfasst, aber die ging entweder unter, oder es hatte niemand Lust, darauf zu atworten...

Jedenfalls ist es auch bei mir so, dass sich etwa der Chat plötzlich aufhängt und in der nächsten Sekunde alle Java-Fenster geschlossen sind und der Login nicht angezeigt wird bzw. die Meldung kommt, dass ich kein Java hätte - bei meinem Bruder ist das selbe Problem aufgetreten.
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It's dangerous to go alone! Take this.